瓶栽食用菌主要的品種是：金針菇、杏鮑菇、蟹味菇、白玉菇、海鮮菇、鹿茸菇等，這些品種中以金針菇的栽培規(guī)模最大，瓶栽金針菇、瓶栽杏鮑菇目前幾乎全部采用的是液體菌種，其他品種有固體菌種，也有液體菌種，本文論述的采用液體菌種的瓶栽食用菌如何降低染菌率，固體菌種將在以后論述。
1、接種漏接引起的染菌
染菌表現(xiàn)：在初期培養(yǎng)結(jié)束，移庫時(shí)可以觀察到個(gè)別栽培瓶沒有菌絲生長，有規(guī)律性和連續(xù)性，通常在一個(gè)固定的位置，但是規(guī)律性因漏接的數(shù)量和不同接種機(jī)接種后混合而不容易發(fā)現(xiàn)，漏接的栽培瓶在后期培養(yǎng)時(shí)通常會表現(xiàn)為霉菌感染，在搔菌去蓋后會看到表面或孔內(nèi)有霉菌感染，一般不表現(xiàn)為細(xì)菌感染。
染菌原因：接種槍頭、管道、電磁閥堵塞，接種機(jī)故障，接種工人操作等導(dǎo)致的個(gè)別栽培瓶完全沒有接入菌種。
解決措施：先從硬件著手，更換容易堵塞的接種槍頭、管道、電磁閥等，加強(qiáng)設(shè)備維護(hù)，減少接種機(jī)因故障停機(jī)維修的次數(shù)。
2、接種量不合適引起的染菌
染菌表現(xiàn)：接種后，料面菌絲恢復(fù)的同時(shí)，在沒有噴灑到菌種的料面開始出現(xiàn)細(xì)菌或者霉菌感染，培養(yǎng)后期，在栽培瓶底部出現(xiàn)類似積水引起的細(xì)菌感染。
染菌原因：前者，是因?yàn)榻臃N量過小而導(dǎo)致液體菌種噴灑不均而間接性引起。后者，是因?yàn)榻臃N量過大而導(dǎo)致的培養(yǎng)基底部積水而引起的。雜菌無論是前者還是后者都是在培養(yǎng)室侵入的，但原因都是接種。
解決措施：對每一個(gè)接種槍頭的接種量進(jìn)行監(jiān)控，確保接種量符合要求，通過調(diào)整槍頭、接種壓力和時(shí)間，將接種量的誤差盡量的控制在允許范圍內(nèi)。
3、接種噴灑不均引起的染菌
染菌表現(xiàn)：接種后48小時(shí)后觀察料面，發(fā)現(xiàn)料面局部沒有萌發(fā)，沒有萌發(fā)的料面進(jìn)而逐漸感染霉菌，一般為青霉居多，有時(shí)也會是綠霉和毛霉。
染菌原因：因接種槍頭的高度，接種壓力，噴灑的開度不合理等原因?qū)е乱后w菌種噴灑不均，沒有覆蓋到整個(gè)料面，對于培養(yǎng)室環(huán)境較差的情況，孔內(nèi)沒有液體菌種流入也會引起相同的染菌現(xiàn)象。
解決措施：挑選更換合適的接種槍頭，調(diào)整接種壓力，讓噴灑開度足以覆蓋到整個(gè)料面，加強(qiáng)接種工人的管理，讓他們意識到不只是監(jiān)測接種量，還有更為重要的接種效果。
4、接種環(huán)境引起的染菌
染菌表現(xiàn)：在培養(yǎng)中期開始在瓶壁或者料面出現(xiàn)細(xì)菌或者霉菌感染，無規(guī)律性，和培養(yǎng)環(huán)境引起的染菌很難區(qū)分，一般通過數(shù)量和位置上進(jìn)行判斷區(qū)分，培養(yǎng)室環(huán)境引起的感染數(shù)量要多于接種環(huán)境引起的染菌，而且培養(yǎng)室引起的染菌通常在培養(yǎng)室的位置上有一定的規(guī)律性。
染菌原因：接種室環(huán)境、接種層流罩環(huán)境不合格。
解決措施：從兩方面著手，一是硬件上，更換接種室和層流罩的高效過濾器，二是加強(qiáng)衛(wèi)生清理工作，同時(shí)輔助臭氧、藥物、紫外線燈等措施，定期進(jìn)行環(huán)境檢測，確保接種室環(huán)境符合要求。
5、接種槍頭不潔引起的染菌
染菌表現(xiàn)：接種后，在初期培養(yǎng)結(jié)束，移庫的時(shí)候，觀察到有個(gè)別的栽培瓶出現(xiàn)細(xì)菌感染，有規(guī)律性，連續(xù)性不明顯，位置固定在一筐的某一個(gè)位置。
染菌原因：因接種槍頭、電磁閥堵塞而進(jìn)行處理之后，對接種頭的消毒處理不到位，進(jìn)而引起染菌。
解決措施：盡量減少接種槍頭、電磁閥堵塞，以及接種機(jī)異常故障停機(jī)、維修的情況，出現(xiàn)后對接種槍頭的消毒處理要徹底。
在瓶栽食用菌生產(chǎn)中，因接種環(huán)節(jié)引起的染菌在整體染菌數(shù)量占有一定的比例，首先要在條件允許的情況下力圖從設(shè)備上解決上述問題，進(jìn)行再在管理上盡量避免類似問題的出現(xiàn)。
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